Croya wurde namentlich 1310 erstmals auf einem Familienvertrag erwähnt.
Der Name Croya entstand aus einem Flurnamen. Das Wort gehört zu altslw. Kroj – Schnede, Rand, Grenze und es bezeichnet immer eine „Flur am Rande“ der Geest, wo diese in eine Niederung übergeht, so hier den Streifen sandigen Landes am Nordrand der feuchten Talsenke, die der Ahnsbek, der spätere Landgraben durchzieht.
Daher auch die Farbwahl. Gelb steht für sandiges Heidland, Grün für den Drömling. Die Wellenlinie, die die beiden Farbfelder voneinander trennt, steht für die Grenze (Kroj). Das Symbol des Schilfkolbens im oberen Gelben Farbfeld steht kennzeichnend für die typische Vegetation dieser Gegend, geprägt durch viele Gräben und Wiesen.